Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rdh16O54909 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh16O54909 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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