Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TsksO54887 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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