Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sp100O35892 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms