Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms