Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkcshO08795 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms