Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ube3aO08759 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3aO08759 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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