Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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MttpO08601 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MttpO08601 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MttpO08601 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MttpO08601 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MttpO08601 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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MttpO08601 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MttpO08601 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MttpO08601 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms