Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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