Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MsmbO08540 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms