Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC024978J3QPC3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms