Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm21818J3KMS6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm21818J3KMS6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21818J3KMS6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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