Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20830J3KML6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20830J3KML6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20830J3KML6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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