Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20828J3KMI7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms