Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r34G3XA52 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms