Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9yF8VPU6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms