Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm8005F6YKY3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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