Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5218F6YH22 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms