Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pagr1bF6V0H0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms