Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccdc71lE9Q4T4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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