Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
ApobE9Q414 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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