Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Myo5cE9Q1F5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Myo5cE9Q1F5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms