Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Krt78E9Q0F0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms