Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fndc1E9Q043 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms