Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gcn1E9PVA8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gcn1E9PVA8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gcn1E9PVA8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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