Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2W7

Cyp3a59, Cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 59, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a59D3Z2W7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp3a59D3Z2W7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp3a59D3Z2W7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms