Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppfia1B2RXQ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppfia1B2RXQ2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms