Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cyp26c1B2RXA7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms