Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rd3lB2RV38 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rd3lB2RV38 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms