Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms