Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zscan5bB2RTN3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zscan5bB2RTN3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms