Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brpf1B2RRD7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms