Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbp4A4UUI3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbp4A4UUI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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