Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttll11A4Q9F4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms