Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5640A3KG49 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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