Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6880A3KG45 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms