Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Rtf1A2AQ19 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtf1A2AQ19 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtf1A2AQ19 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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