Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ambra1A2AH22 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ambra1A2AH22 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms