Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm11A2AGX3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms