Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RNP2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms