Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Top3bQ9Z321 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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