Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Homer1Q9Z2Y3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms