Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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