Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn13Q9Z0S4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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