Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip1Q9WUU8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnip1Q9WUU8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms