Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nfe2l3Q9WTM4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nfe2l3Q9WTM4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nfe2l3Q9WTM4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nfe2l3Q9WTM4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms