Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sema6cQ9WTM3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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