Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam50bQ9WTJ8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fam50bQ9WTJ8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms