Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh2d3cQ9QZS8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh2d3cQ9QZS8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh2d3cQ9QZS8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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