Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gpc1Q9QZF2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc1Q9QZF2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc1Q9QZF2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gpc1Q9QZF2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gpc1Q9QZF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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