Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tnnt3Q9QZ47 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnt3Q9QZ47 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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